Martie 1865. În Statele Unite în timpul războiului civil, cinci nordici îndrăzniți fug de un Richmond capturat de sudici într-un balon. O furtună cumplită aruncă patru dintre ele pe țărmul unei insule nelocuite din emisfera sudică. Al cincilea bărbat și câinele său se ascund în mare în largul coastei. Această a cincea - un anume Cyres Smith, un inginer talentat și un om de știință, sufletul și liderul unui grup de călători - își păstrează în mod involuntar tovarășii în tensiune timp de câteva zile, care nu pot găsi nicăieri nici el, nici câinele de top dedicat lui. Fostul sclav suferă cel mai mult, iar servitorul fidel al lui Smith este Negrul Nab. În balon se aflau și un jurnalist de război și prietenul lui Smith, Gideon Spilet, un bărbat foarte energic și decisiv, cu o minte zburătoare; marinar Pencrof, un îndrăzneț de bun-simț și aventuros; Harbert Brown, în vârstă de cincisprezece ani, fiul căpitanului navei pe care Pencrof a navigat, a rămas orfan și căruia marinarul îl tratează ca pe propriul său fiu. După o căutare obositoare, Nab își găsește în cele din urmă gazda salvată inexplicabil, la un kilometru de coastă. Fiecare dintre noii coloniști ai insulei are talente de neînlocuit, iar sub conducerea Cyres și Spilet, acești oameni curajoși se raliează și devin o echipă unită. Mai întâi, folosind cele mai simple mijloace la îndemână, apoi producând obiecte din ce în ce mai complexe de munci și de uz casnic în propriile mici fabrici, coloniștii își echipează viața. Ei vânează, colectează plante comestibile, stridii, apoi chiar cresc animale domestice și se angajează în agricultură. Ei aranjează locuințe pentru ei înalți în stâncă, într-o peșteră eliberată de apă. Curând, datorită muncii grele și inteligenței lor, coloniștii nu mai știu nevoia de mâncare, haine, căldură și confort. Au totul, cu excepția veștilor despre patria lor, a căror soartă sunt foarte îngrijorați.
Odată, întorcându-se în locuința lor, numită de ei Palatul Granitului, ei văd că maimuțele se bat în interior. După ceva timp, parcă sub influența fricii nebunești, maimuțele încep să sară pe ferestre, iar mâna cuiva aruncă scara de frânghie pe care maimuțele au ridicat-o în casă. În interior, oamenii găsesc o altă maimuță - un orangutan, pe care îl păstrează și îl numesc Uncle Jupe. În viitor, Jupe devine un prieten, servitor și ajutor indispensabil oamenilor.
Într-o altă zi, coloniștii găsesc în nisip o cutie cu instrumente, arme de foc, diverse aparate, haine, ustensile de bucătărie și cărți în engleză. Coloniștii se întreabă de unde ar putea veni această cutie. Din harta, care a apărut și în casetă, ei află că lângă insula lor, pe harta care nu este marcată, se află insula Tabor. Marinarul Pencrof este dornic să meargă la el. Cu ajutorul prietenilor, construiește un bot. Când botul este gata, toți împreună merg pe el pentru o călătorie de testare în jurul insulei. În timpul acesteia, ei găsesc o sticlă cu o notă care spune că omul naufragiat așteaptă salvarea pe insula Tabor. Acest eveniment consolidează încrederea lui Pencroff în vizita unei insule vecine. Pencrof, jurnalistul Gideon Spilet și Harbert au navigat. Ajungând la Tabor, descoperă o mică cătușă în care, din toate indicațiile, nimeni nu trăiește de mult timp. Se împrăștie în jurul insulei, fără a spera să vadă o persoană vie, și încearcă să găsească cel puțin rămășițele sale. Deodată, aud Harbert urlând și grăbindu-se în ajutorul lui. Îl văd pe Harbert luptându-se cu un fel de creatură crescută de maimuță. Totuși, maimuța se dovedește a fi un om feroce. Călătorii îl legă și îl transportă pe insula lor. Îi oferă o cameră separată în Palatul Granitului. Datorită atenției și preocupărilor lor, sălbaticul se transformă curând înapoi într-un bărbat civilizat și le spune povestea sa. Se dovedește că numele său este Ayrton, el este un fost criminal, a vrut să intre în posesia navei navigabile Duncan și cu ajutorul acelorași dreguri ale societății s-a transformat într-o navă pirată. Cu toate acestea, planurile sale nu erau destinate să devină realitate, iar ca pedeapsă în urmă cu doisprezece ani, el a fost lăsat pe insula Tabor nelocuită, astfel încât să își dea seama de fapta sa și de ispășire pentru păcatul său. Cu toate acestea, proprietarul „Duncanului” Eduard Glenarvan a spus că într-o zi se va întoarce pentru Ayrton. Coloniștii văd că Ayrton se pocăiește sincer de păcatele sale trecute și încearcă să le fie de folos în toate felurile. Prin urmare, ei nu sunt înclinați să-l judece pentru comportamente greșite din trecut și îl acceptă de bunăvoie în societatea lor. Cu toate acestea, Ayrton are nevoie de timp și, prin urmare, el cere o oportunitate de a trăi în coralul pe care coloniștii l-au construit pentru animalele lor domesticite, la oarecare distanță de Palatul Granitului.
Când botul s-a întors noaptea din insula Tabor, a fost salvat de un foc, care, așa cum credeau ei, plutind pe el, a fost aprins de prietenii lor. Cu toate acestea, se dovedește că nu au fost implicați în acest lucru. De asemenea, se dovedește că Ayrton nu a aruncat o sticlă de notă în mare. Coloniștii nu pot explica aceste evenimente misterioase. Aceștia sunt din ce în ce mai înclinați către ideea că, pe lângă ei, pe insula Lincoln, pe măsură ce l-au creștinat, există altcineva, binefăcătorul lor misterios, care vine adesea în ajutorul lor în cele mai dificile situații. Au pornit chiar într-o expediție de căutare în speranța localizării locului său de reședință. Cu toate acestea, căutarea nu se termină.
Vara următoare (pentru că Ayrton a apărut pe insula lor și înainte să le spună povestea sa, au trecut deja cinci luni, iar vara s-a terminat și este periculos să navighezi în sezonul rece), ei decid să revină la Insulele Tabor pentru a lăsa o notă în colibă. În notă, ei intenționează să-l avertizeze pe căpitanul Glenarvan dacă va întoarce că Ayrton și celelalte cinci victime ale accidentului așteaptă ajutor pe o insulă vecină.
Coloniștii locuiesc pe insula lor de trei ani. Viața, economia lor au atins prosperitatea. Aceștia recoltează deja culturi bogate de grâu cultivate dintr-un singur bob, care a fost găsit în buzunarul lui Harbert în urmă cu trei ani, au construit o moară, au ridicat păsări de curte, și-au echipat complet locuința, și-au confecționat noi haine și pături calde din lână de muflon. Cu toate acestea, viața lor pașnică este umbrită de un incident care îi amenință cu moartea. Odată, privind spre mare, ei văd o navă bine echipată în depărtare, dar un steag negru zboară deasupra navei. Nava se ancorează în largul coastei. Prezintă arme frumoase pe distanțe lungi. Ayrton se strecoară în navă sub acoperirea nopții pentru a efectua recunoaștere. Se dovedește că pe corabie sunt cincizeci de pirați. Alunecând miraculos de ei, Ayrton se întoarce pe țărm și le spune prietenilor săi că trebuie să se pregătească pentru luptă. În dimineața următoare, două bărci coboară de pe navă. Pe primul, coloniștii împușcă trei dintre ei, iar ea se întoarce, a doua aterizează pe plajă, iar cei șase pirați rămași ascunși în pădure. Tunurile sunt scârțâite de pe navă și se apropie și mai aproape de țărm. Se pare că nimic nu are puterea de a salva o mână de coloniști. Dintr-o dată un val uriaș se ridică sub navă și se scufundă. Toți pirații de pe el mor. După cum se dovedește mai târziu, nava a fost aruncată în aer de o mină, iar acest eveniment îi convinge în sfârșit pe locuitorii insulei că nu sunt singuri aici.
La început, ei nu vor extermina pirații, dorind să le ofere posibilitatea de a duce o viață pașnică. Dar se dovedește că tâlharii nu sunt capabili de acest lucru. Încep să jefuiască și să ardă gospodăriile coloniștilor. Ayrton merge la coral pentru a vizita animalele. Pirații îl apucă și îl duc într-o peșteră, unde vor să-l tortureze, pentru a fi de acord să meargă de partea lor cu tortură. Ayrton nu renunță. Prietenii lui merg în ajutorul lui, dar sunt răniți grav în coralul lui Harbert, iar prietenii lui rămân în el, neputând să se întoarcă cu tânărul care murise. După câteva zile, pleacă în continuare spre Palatul Granitului. În urma tranziției, Harbert începe o febră malignă, se află la moarte. Încă o dată, providența intervine în viața lor și mâna bunului lor prieten misterios le aruncă medicamentul necesar. Harbert se recuperează pe deplin. Coloniștii intenționează să ofere lovitura finală piraților. Ei merg la coral, unde intenționează să-i găsească, dar îl găsesc pe Ayrton, care este epuizat și abia în viață, și în apropiere, cadavrele tâlharilor. Ayrton relatează că nu știe cum a ajuns în coral, care l-a adus din peșteră și i-a ucis pe pirați. Cu toate acestea, el raportează o veste tristă. În urmă cu o săptămână, bandiții au plecat la mare, dar, neștiind cum să controleze botul, l-au rupt pe recifele de coastă. Călătoria în Tabor trebuie amânată până la construcția unui vehicul nou. În următoarele șapte luni, străinul misterios nu se face simțit. Între timp, un vulcan se trezește pe insulă, despre care coloniștii credeau că era deja mort. Construiesc o nouă navă mare, care, dacă este necesar, le-ar putea livra pe pământuri locuite.
Într-o seară, deja pregătindu-se să se culce, locuitorii Palatului Granitului aud un clopot. Telegraful pe care l-au petrecut de la coral la casa lor funcționează. Sunt chemați de urgență în coral. Acolo găsesc o notă care le cere să meargă pe firul suplimentar. Cablul îi conduce spre o grotă imensă, unde, spre uimirea lor, văd un submarin. În ea, se întâlnesc cu stăpânul și patronul lor, căpitanul Nemo, prințul indian Dakkar, care a luptat pentru independența patriei sale toată viața. El, deja un bărbat de șaizeci de ani care și-a îngropat toți asociații, este aproape de moarte. Nemo le oferă noilor prieteni un sicriu cu bijuterii și avertizează că, atunci când vulcanul erupe, insula (așa este structura ei) va exploda. El moare, coloniștii ridică trapa barcii și o coboară sub apă și construiesc noua navă neobosită toată ziua. Cu toate acestea, nu au timp să o termine. Toată viața piere în timpul exploziei insulei, din care rămâne doar un mic recif în ocean. Coloniștii, care au petrecut noaptea într-un cort pe plajă, sunt aruncați în mare de valurile de aer. Toți aceștia, cu excepția Jupe, rămân în viață. De mai bine de zece zile stau pe recif, aproape că mor de foame și nu mai speră nimic. Deodată văd o corabie. Acesta este Duncan. El salvează pe toată lumea. După cum se dovedește mai târziu, căpitanul Nemo, în timp ce botul era încă intact, plutea pe el spre Tabor și lăsă o notă salvatorilor.
Revenind în America pentru bijuterii donate de căpitanul Nemo, prietenii cumpără o bucată mare de pământ și trăiesc pe ea la fel cum au trăit pe insula Lincoln.